LinuxOSのスタンダードイメージは、kernel 以外のパッケージがアップデートされることはありますか。

お客様にて yum update を実施しない限り自動でアップデートされることはございません。
ただし、脆弱性対応等により、スタンダードイメージの一部パッケージをニフクラ側でアップデートすることがございます。

そのため、サーバ作成時期により、OSイメージの中に入っているパッケージのバージョンが、kernelのバージョンと一致しないことがあります。